Bij het kijkonderzoek van de luchtpijp en longen wordt de camera rechtstreeks via de luchtpijp ingebracht. Zo kan er onder meer gekeken worden hoe erg de afplatting van de luchtpijp is en of er een vreemd voorwerp of massa zit. Er kan ook een spoeling van de longen worden uitgevoerd om infectieuze processen op te sporen. Deze endoscopie wordt dus meestal voorgesteld bij chronische luchtwegproblemen zoals hoesten of een veranderde ademhaling.